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潛力無限!城大化學(xué)家研發(fā)新型的獨(dú)特RNA結(jié)構(gòu)靶向工具,為癌癥治療研究提供新思路

 

負(fù)責(zé)將儲(chǔ)存在DNA內(nèi)的遺傳密碼解碼并產(chǎn)生蛋白質(zhì)的核糖核酸(Ribonucleic acids, RNAs),會(huì)折疊成不同的結(jié)構(gòu),以控制包括人類在內(nèi)的各種生物的基本生理過程。而透過小分子來找出與疾病相關(guān)的RNA結(jié)構(gòu),一直是科學(xué)界研發(fā)靶向RNA藥物(RNA-targeting drugs)的金科玉律。最近,香港城市大學(xué)(城大)的研究團(tuán)隊(duì)便開發(fā)了一種新型的RNA結(jié)構(gòu)靶向工具,毋須靶向小分子,依然能針對(duì)地識(shí)別出與癌癥和神經(jīng)系統(tǒng)疾病等有關(guān)的獨(dú)特四鏈(four-stranded)RNA結(jié)構(gòu)。團(tuán)隊(duì)的發(fā)現(xiàn)或有助于進(jìn)一步開發(fā)出相關(guān)疾病的治療工具。

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RNA中富含鳥嘌呤的序列(G-rich sequences)可以折疊成由鉀離子(K+)維系著的G-四分體(G-quartets)。而rG4則是由G-四分體堆疊而成,并與癌癥、神經(jīng)系統(tǒng)疾病和病毒的致病機(jī)理有關(guān)。(圖片來源:郭駿杰博士)

研究由來自城大化學(xué)系及海洋污染國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室的副教授郭駿杰博士領(lǐng)導(dǎo),研究結(jié)果已于學(xué)術(shù)期刊《Nature Protocols》上發(fā)表,題為〈Development of RNA G-quadruplex (rG4) targeting L-RNA aptamers by rG4-SELEX〉。

與癌癥和神經(jīng)系統(tǒng)疾病相關(guān)的RNA G-四鏈體

郭博士說:“我們是全球首個(gè)研究團(tuán)隊(duì),成功研發(fā)出一種新型的工具,能夠靶向RNA G-四鏈體(RNA G-quadruplex,簡稱rG4)的L-RNA核酸適體(aptamers)。我們的研究數(shù)據(jù)表明,這些新開發(fā)的L-RNA核酸適體能選擇性地靶向特定的rG4目標(biāo),并精準(zhǔn)地與之結(jié)合,表現(xiàn)更比現(xiàn)時(shí)最前沿的rG4靶向小分子更好。”他形容團(tuán)隊(duì)的研究成果“令人鼓舞”,并說:“我們的成果為選擇性靶向rG4提供了嶄新及重要的方向,而且可能適用于靶向DNA和RNA中其他不常見的核酸結(jié)構(gòu)。”

那到底什么是RNA G-四鏈體呢?RNA G-四鏈體簡稱rG4,是由RNA序列形成的一種特殊結(jié)構(gòu),見于人類、植物、細(xì)菌和病毒中,能成為結(jié)構(gòu)“支架”讓蛋白質(zhì)結(jié)合形成,并發(fā)揮不同的生物學(xué)功能。個(gè)別的rG4已被發(fā)現(xiàn)于細(xì)胞中具有重要的功能和扮演基因調(diào)控的角色,近期的研究還發(fā)現(xiàn)了rG4與癌癥、神經(jīng)系統(tǒng)疾病和病毒致病機(jī)理有關(guān)。

而要進(jìn)一步鉆研rG4,首先就要找到它們。一直以來,靶向功能性rG4的主要方法是運(yùn)用小分子配體(ligands),即是分子量(molecular weight)輕的有機(jī)或無機(jī)化合物。郭博士解釋道:“不過大多數(shù)的rG4配體都無法區(qū)分具有相似結(jié)構(gòu)的rG4,這對(duì)要選擇性靶向指定rG4以進(jìn)行基因調(diào)控,構(gòu)成一大挑戰(zhàn)。”

全新解決方案︰以嶄新L-RNA核酸適體靶向rG4

為克服上述挑戰(zhàn),郭博士和他的團(tuán)隊(duì)研發(fā)出“基于L-RNA核酸適體以靶向rG4”的全新解決方案,為科研界解決長期存在的問題。核酸適體是單鏈、短的DNA或RNA分子,折疊成特定結(jié)構(gòu),并與金屬離子和蛋白質(zhì)等特定目標(biāo)結(jié)合。

郭博士和團(tuán)隊(duì)花上將近兩年的時(shí)間,建立起他們命名為“rG4-SELEX”的核酸適體揀選平臺(tái),研發(fā)出可以靶向特定rG4的不同L-RNA核酸適體。

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L-RNA核酸適體和rG4目標(biāo)的結(jié)合親和力分析。圖A及B顯示了L-Apt.3-7與TERRA rG4的結(jié)合,圖C及D則是L-Apt.4-1c與hTERC rG4的結(jié)合。這些數(shù)據(jù)表明,團(tuán)隊(duì)研發(fā)出的L-RNA核酸適體與其rG4目標(biāo)有強(qiáng)大的結(jié)合親和力。(圖片來源:Mubarak I. Ishaq, Chun-Yin Chan et al./DOI number: 10.1038/s41596-022-00679-6)

他們?cè)趯?shí)驗(yàn)中發(fā)現(xiàn),被他們稱為“L-Apt.3-7”的其中一種L-RNA核酸適體,可以與其目標(biāo)rG4緊密結(jié)合,而且在實(shí)驗(yàn)中沒有混淆其他類似的rG4結(jié)構(gòu)。這個(gè)結(jié)果可謂是首次發(fā)現(xiàn)到運(yùn)用L-RNA核酸適體,可以選擇性靶向rG4。

團(tuán)隊(duì)還證明了L-RNA核酸適體可用來干擾rG4與蛋白質(zhì)之間的相互作用,從而截停其生化和細(xì)胞功能,加以調(diào)控的話,或可作治療。根據(jù)團(tuán)隊(duì)的實(shí)驗(yàn)結(jié)果,相對(duì)于目前最前沿的rG4靶向配體,L-RNA核酸適體的表現(xiàn)可以匹敵,甚至有過之而無不及。

潛力無限,日后或可用于治療疾病

郭博士總結(jié)說:“在這次研究中,我們首次引入了能幫助大力開發(fā)L-RNA核酸適體的通用框架,以用于靶向與生物學(xué)和治療相關(guān)的rG4結(jié)構(gòu),和找出rG4-蛋白質(zhì)之間的相互作用。我們的研究結(jié)果提供了新的靶向策略,日后或可用于治療疾病。”

郭博士和他的團(tuán)隊(duì)目前正研究以靶向rG4的L-RNA核酸適體,來靶向人體的編碼RNA和解碼RNA之中數(shù)個(gè)與疾病相關(guān)的rG4結(jié)構(gòu),和rG4-蛋白質(zhì)的相互作用。

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城大化學(xué)系副教授郭駿杰博士(前排中)與他的研究團(tuán)隊(duì)。Umar Mubarak Ishaq博士(后排右三)和陳俊彥先生(后排右一)均是第一作者。

郭博士預(yù)計(jì)進(jìn)一步完善這個(gè)核酸適體揀選的平臺(tái)后,將能夠用高通量的方式開發(fā)出不同的L-核酸適體,以靶向RNA結(jié)構(gòu),從而或可應(yīng)用于治療如 COVID-19的人類疾病。他補(bǔ)充說:“我堅(jiān)信追求技術(shù)上的創(chuàng)新自然會(huì)推動(dòng)我們探索生物學(xué),并衍生更深入的理解。”

郭博士是論文的通訊作者。而來自城大化學(xué)系及海洋污染國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室的Umar Mubarak Ishaq博士陳俊彥先生均是第一作者。

是次研究獲得城大、香港研究資助局、裘槎基金會(huì)、深圳市基礎(chǔ)研究項(xiàng)目和香港城大海洋污染國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室的資助而進(jìn)行。

DOI number: 10.1038/s41596-022-00679-6

本文于 “香港城大研創(chuàng)” 微信公眾號(hào)發(fā)布。
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